Cette zone qui n’a jamais été exploitée par les sociétés forestières présente un intérêt botanique et biologique. Riche en faune et en flore, ce parc compte de nombreuses espèces de grands mammifères tels les éléphants, les gorilles de plaines de l’Ouest, les chimpanzés, les panthères ; les potamochères, les buffles, etc. Aussi, plus de 300 espèces d’oiseaux ; 1000 espèces de plantes et une riche diversité de forêts. Des marécages en forêt inondée abritent différentes espèces dont les céphalophes bleus à dos jaune et à front noir. Les trois espèces de crocodiles d'Afrique vivent dans le parc national, où des tortues d'eau douce fréquentent les marécages et bais.
La zone protégée par le parc national de Nouabalé-Ndoki est l'une des dernières régions d'Afrique centrale où les éléphants sont à l'abri des chasseurs. La conservation et les études sur les animaux et les plantes sont effectuées par Wildlife Conservation Society (WCS), en collaboration avec le Gouvernement congolais. A l’intérieur du parc, on circule en 4x4, en pirogue et à pied avec des guides et pisteurs. Autour du bai de Mbeli, des pistages à pied sont organisés dans la forêt.
Au cours des 10 dernières années, les activités du parc sont axées sur le développement et la mise en œuvre des systèmes efficaces et des stratégies de protection, de recherche, de surveillance et de l'administration, d'importants programmes de renforcement des capacités notamment sur la gestion évolutive des structures et du personnel en place, afin de répondre aux menaces émergentes dans le paysage.