Les résultats officiels avaient donné le fils de l'ex-président Omar Bongo vainqueur de ce scrutin mais l'opposition affirmait qu'il était entâché d'irrégularités.
Un recomptage des voix avait été ordonné fin septembre et créditait Bongo d'un score de 41,8% des suffrages. Les résultats de deux bureaux de vote seulement ont été annulés. L'opposition, avant l'annonce de cette décision, avait indiqué qu'elle resterait mobilisée.
Ali Bongo va donc succéder à son père Omar qui a dirigé le Gabon pendant plus de 40 ans jusqu'à sa mort au mois de juin. Des violences avaient éclaté à Port-Gentil, la deuxième ville du pays, après l'annonce du résultat début septembre.